Gelek celeb peptîdên transmembrane hene, û dabeşkirina wan li ser taybetmendiyên laşî û kîmyewî, çavkanî, mekanîzmayên vexwarinê, û serîlêdanên biyolojîkî ye.Li gorî taybetmendiyên xwe yên fizîkî û kîmyewî, peptîdên ku di nav perdeyê de derbas dibin li sê celeb têne dabeş kirin: kationîk, amfîfîlîk û hîdrofobîk.Peptîdên ku di perdeya kationîk û amfîfîlîk de derbas dibin ji sedî 85% in, lê peptîdên ku di perdeya hîdrofobîk de derbas dibin tenê% 15 e.
1. Peptîdê penetrî membrana kationîk
Peptîdên transmembrane yên kationîk ji peptîdên kurt ên ku bi argînîn, lîzîn û hîstidîn dewlemend in, wek TAT, Penetratin, Polyarginine, P22N, DPV3 û DPV6 pêk tên.Di nav wan de, argînîn guanidine dihewîne, ku dikare bi komên asîdê fosforîk ên neyînî yên barkirî yên li ser perdeya hucreyê ve girêbide û di bin şertê nirxa PH-ya fîzyolojîk de peptîdên transmembrane bike nav membranê.Lêkolînên li ser oligarginine (ji 3 R heta 12 R) destnîşan kir ku şiyana pêketina membranê tenê dema ku mîqdara argînîn bi qasî 8 kêm bû bi dest ket, û bi zêdebûna mîqdara argînîn re şiyana pêketina membranê hêdî hêdî zêde bû.Lîsîn, her çend wekî argînîn kationîk be jî, guanidine nahewîne, ji ber vê yekê gava ku ew bi tenê hebe, karûbarê wê ya ketina membranê ne pir zêde ye.Futaki et al.(2001) dît ku bandora pêketina membranê ya baş tenê dema ku peptîda penetîra şaneya hucreya kationîk herî kêm 8 asîdên amînî yên bi pozîtîf barkirî hebin dikare were bidestxistin.Her çend bermayiyên asîda amînî yên bi erênî barkirî ji bo peptîdên penetrîfker hewce ne ku derbasî membranê bibin, asîdên amînî yên din jî bi heman rengî girîng in, wek mînak dema ku W14 di nav F de diguhezîne, têketina Penetratin winda dibe.
Çînek taybetî ya peptîdên transmembrane yên kationîk rêzikên herêmîkirina nukleerî (NLSs) ne, ku ji peptîdên kurt ên bi argînîn, lîzîn û prolîn dewlemend in pêk tê û dikare bi navokê bi navgîniya pora nukleerê ve were veguheztin.NLS dikarin bêtir li tîpên yek û ducar bêne dabeş kirin, ku bi rêzê ve ji yek û du komikên asîdên amînî yên bingehîn pêk tê.Mînakî, PKKKRKV ji vîrûsa simîan 40 (SV40) NLS-yek tîpkirî ye, lê proteîna nukleerî NLS-ya ducarî ye.KRPAATKKAGQAKKKL rêzika kurt e ku dikare di transmembrana membranê de rolek bilîze.Ji ber ku piraniya NLS-ên jimareyên barkirinê ji 8 kêmtir in, NLS ne peptîdên transmembranî yên bi bandor in, lê ew dikarin bibin peptîdên transmembranî yên bi bandor gava ku bi hevrêzî bi rêzikên peptîdên hîdrofobîk ve werin girêdan da ku peptîdên transmembrane yên amfîfîlî çêbikin.
2. Peptide transmembrane Amphiphilic
Peptîdên transmembrane yên amfîfîlîk ji domên hîdrofîl û hîdrofobîk pêk tên, ku dikarin di nav amfîfîlîk a seretayî, amfîfîlîk α-helîk a navîn, amfîfîlîk β-pêçandin û amfîfîlîk-prolin-dewlemendkirî de bêne dabeş kirin.
Peptîdên membrana kincên amfîfîlîk ên seretayî li du kategoriyan, kategoriya bi NLS-yên kovalentî bi rêzika peptîdên hîdrofobîk ve girêdayî ne, wek MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) û Pep - 1 (KETWWETWWTEWSQPKKKRKV), Her du jî li ser hîdrofobîkbûna navokî ya PKKV0RKV-yê bingeh in. qada MPG bi rêzika hevgirtinê ya glycoprotein 41 HIV (GALFLGFLGAAGSTMG A) ve girêdayî ye, û qada hîdrofobîk a Pep-1 bi komika dewlemend a trîptofanê ya bi hevrêziya membranê ya bilind ve girêdayî ye (KETWWET WWTEW).Lêbelê, domên hîdrofobîk ên her duyan bi nîşana herêmîkirina navokî PKKKRKV bi navgîniya WSQP ve girêdayî ne.Çînek din a peptîdên transmembranê yên amfîfîlîk ên seretayî ji proteînên xwezayî, wek pVEC, ARF (1-22) û BPrPr (1-28) hate veqetandin.
Peptîdên transmembrana amfîfîlîk a-helîk ên duyemîn bi navgîniya α-helîcan ve bi membranê ve girêdidin, û bermahiyên wan ên asîda amînî ya hîdrofîl û hîdrofobîk li ser rûberên cihêreng ên avahiya helîkî, wek MAP (KLALKLALK ALKAALKLA) cih digirin.Ji bo membrana kincên amfîfîlîk a peptîdê ya pelçiqandî ya beta, şiyana wê ya ku çêdike pelek beta-pişkkirî ji şiyana pêketina wê ya membranê re girîng e, wek mînak di VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) de di pêvajoya lêkolîna li ser şiyana penetkirinê ya membranê de, bi karanîna celebê D. - Analogên mutasyona asîda amînî nekarîn perçeyek beta ya pêçandî ava bikin, şiyana penetkirinê ya membranê pir kêm e.Di peptîdên transmembrane yên amfîfîlîk ên dewlemendkirî de, polyproline II (PPII) bi hêsanî di ava paqij de çêdibe dema ku proline di avahiya polîpeptîdê de pir dewlemend bibe.PPII helixek çepgir e ku di her zivirînê de 3.0 bermayiyên asîda amînî hene, berevajî avahiya standard a alpha-helix-a rastê ya ku di her zivirî de 3.6 bermayiyên asîda amînî hene.Peptîdên transmembrane yên amfîfîlîk ên dewlemendkirî yên bi prolîn peptîdê antîmîkrobial 7 (Bac7), polîpeptîdê sentetîk (PPR) n (n dikare bibe 3, 4, 5 û 6), hwd.
3. Perçeya hîdrofobîk a peptîdê dikevin
Peptîdên transmembrane yên hîdrofobîk tenê bermahiyên asîda amînî yên ne-polar dihewîne, bi barek netîce ji% 20-ê bareya giştî ya rêza asîda amînî kêmtir e, an jî hêmanên hîdrofobîk an komên kîmyewî yên ku ji bo transmembranê bingehîn in hene.Her çend van peptîdên transmembranê yên hucreyî bi gelemperî têne paşguh kirin jî, ew hene, wekî faktora mezinbûna fibroblast (K-FGF) û faktora mezinbûna fibroblast 12 (F-GF12) ji sarkoma Kaposi.
Dema şandinê: Mar-19-2023