Plana sêwiranê û çareseriya zincîra peptîdê ya polypeptide

I. Kurte
Peptîd makromolekulên taybetî ne ku rêzikên wan di taybetmendiyên kîmyewî û fizîkî de ne asayî ne.Sentezkirina hin peptîd dijwar e, hinên din jî bi hêsanî têne çêkirin, lê paqijkirina wan dijwar e.Pirsgirêka pratîkî ev e ku piraniya peptîd di nav çareseriyên avî de hindik têne çareser kirin, ji ber vê yekê di safîkirina me de, divê beşa têkildar a peptîda hîdrofobîk di halên ne-avî de were hilweşandin. prosedurên ezmûnî yên biyolojîkî, da ku teknîsyen bi tundî qedexe ne ku peptîdê ji bo armancên xwe bikar bînin, ji ber vê yekê li jêr çend aliyên sêwirana peptîd ji bo lêkolîneran hene.

Plana sêwiranê û çareseriya zincîra peptîdê ya polypeptide
Ya duyemîn, hilbijartina rast a peptîdên dijwar ên sentetîk
1. Bi tevahî dirêjahiya rêzikên jêrîn-rêkûpêkkirî
Peptîdên ji 15 bermayiyan kêmtir têne bidestxistin ji ber ku mezinahiya peptîdê zêde dibe û paqijiya hilbera xav kêm dibe.Ji ber ku dirêjahiya giştî ya zincîra peptîdê ji 20 bermayiyan wêdetir zêde dibe, hêjmara hilberê ya rastîn xemek sereke ye.Di gelek ceribandinan de, bi kêmkirina hejmara bermayiyê li jêr 20-ê hêsan e ku meriv bandorên nediyar bistînin.
2. Hejmara bermahiyên hîdrofobîk kêm bikin
Peptîdên bi serdestiyek mezin a bermahiyên hîdrofobîk, nemaze li herêma 7-12 bermayiyên ji C-terminus, bi gelemperî dibin sedema zehmetiyên sentetîk.Ev wekî têkeliyek bêkêmasî tê dîtin ji ber ku pelek B-qatî di sentezê de tê wergirtin."Di rewşên weha de, dibe ku kêrhatî be ku ji du zêdetir bermahiyên erênî û neyînî veguherînin, an jî Gly an Pro bixin nav peptîdê da ku pêkhateya peptîdê vekin."
3. Daxistina bermahiyên "zehmet".
"Hejmarek bermahiyên Cys, Met, Arg, û Try hene ku bi gelemperî bi hêsanî nayên sentez kirin."Ser dê bi gelemperî wekî alternatîfek ne-oxidative ji Cys re were bikar anîn.
Plana sêwiranê û çareseriya zincîra peptîdê ya polypeptide

Ya sêyem, bijartina rast a ku di avê de tê çareser kirin baştir bike
1. Eyar N an C termînalê
Bi peptîdên asîd re têkildar (ango, di pH 7 de bi neyînî barkirî ye), acetilasyon (astîlasyona N-terminus, C termînalê her gav komek karboksîl a belaş diparêze) bi taybetî tê pêşniyar kirin ku barê neyînî zêde bike.Lêbelê, ji bo peptîdên bingehîn (ango, di pH 7 de bi erênî têne barkirin), amînasyon (koma amînî ya belaş li dawiya-N û amînasyon li dawiya C) bi taybetî tê pêşniyar kirin ku barê erênî zêde bike.

2. Rêzê pir kurt an dirêj kirin

Di hin rêzan de hejmareke mezin a asîdên amînî yên hîdrofobîk hene, wek Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr û Ala, hwd. Dema ku ev bermahiyên hîdrofobîk ji %50 derbas bibin, bi gelemperî ne hêsan têne hilweşandin.Dibe ku dirêjkirina rêzikê kêrhatî be da ku polên erênî û neyînî yên peptîdê bêtir zêde bikin.Vebijarka duyemîn ev e ku meriv mezinahiya zincîra peptîdê kêm bike da ku bi kêmkirina bermahiyên hîdrofobîk polên erênî û neyînî zêde bike.Aliyên erênî û neyînî yên zincîra peptîdê çiqas bihêztir be, îhtîmal e ku ew bi avê re reaksiyonê bike.
3. Di nav bermayek avê de avêtin
Ji bo hin zincîreyên peptîdê, berhevoka hin asîdên amînî yên erênî û neyînî dikare çareserbûna avê baştir bike.Pargîdaniya me N-terminus an C-dawiya peptîdên asîd pêşniyar dike ku bi Glu-Glu re bêne hev kirin.N an C dawiya peptîda bingehîn hat dayîn û paşê Lys-Lys.Ger koma barkirî nekare were danîn, Ser-Gly-Ser jî dikare di dawiya N an C de were danîn.Lêbelê, ev nêzîkatî gava ku aliyên zincîra peptide neyên guheztin kar nake.